Systemets ventilasjon må utføres veldig nøye. På den ene siden må gjæringsgassen fra septiktankene fjernes, og på den annen side må riktig ventilasjon av Biorock-behandlingsenheten sikres.
Diameteren som er angitt i BIOROCK-instruksjonene er 100 mm. Dette er den europeiske standarden og det er fra dette perspektivet at BIOROCK-systemet har bestått innledende sertifiseringstester og brukes i andre land.
De 110 mm diameter som brukes mye i Storbritannia er et minimum. Som en metode til å ta de nødvendige forholdsregler, som med installasjon av et sanitetsventilasjonssystem, bør det ikke være 90 ° vinkler. Systemet fungerer perfekt med 45 ° vinkler uten bakoverhelling. Diameteren på innløpsledningene i septiktanken må være minst lik diameteren på bygningens avløpsutløp.